Bonjour,
Je souhaiterais que soit créé ldeux projets pour mon compte (login leulliot):
J’en profite aussi pour vous demander s’il est possible d’installer le
logiciel Cryosparc pour le traitement de données de Microscopie
electronique?
Je n’ai jamais utilisé sur un cluster mais ca a l’air d’être possible:
Bien cordialement,
Nicolas
Bonjour,
Pourriez-vous m’indiquer le volume max estimé des données générées pour chacun des deux projets ?
Y’a-t-il d’autres personnes à associer à ces projets ?
Je vais regarder pour installer cryosparc.
Merci.
Cordialement.
Pour Helicase ca sera du alphafold donc pas grand chose.
Pour Cryo ca peut grimper, un jeu complet ca peut faire jus’à 7Tb, mais
nous allons commencer avec les particules extraites donc besoin de 1 ou
2 Tb.
Il y aura des personnes à associer, mais pour l’instant n’ont pas de
compte, ni de formation. on fera ca dans un deuxième temps.
Merci!
Nicolas
mer. 03 avril 2024 à 12:32, discourse-admin@rpbs.univ-paris-diderot.fr a écrit :
Bonjour,
J’ai créé les deux projets (vous avez du recevoir des mails).
J’ai fait une demande licence sur le site de CryoSPARC, j’attends la réponse.
Cordialement.
Bonjour,
J’ai installé le logiciel CryoSPARC 4.4.1 (via le pipeline gitlab du NNCR).
Deux environnements ont été créés:
Par contre je ne suis pas sûr de la façon de faire tourner ce logiciel. Peut-être voir directement sur https://community.france-bioinformatique.fr/ ?
Cordialement.