Hhsuite Pfam UniRef30

iPOP-UP Installation requests
1

Bonjour,

J’ai assisté à la formation au cluster ipop-up du 12 juin durant laquel j’ai vu qu’on pouvait faire des demandes d’installation de banques. J’ai besoin d’utiliser les banques UniRef30_2022_02 et pfam35. J’ai fais une demande sur community.france-bioinformatique.fr (Installation HH-suite, UniRef30 et pfam35 - Demande de logiciel ou de banque de données - IFB Community Support).

J’aurai voulu savoir si c’est possible, comment accéder aux banques qui ont été installé dans /shared/bank/hhsuite/pfam/current/ et /shared/bank/hhsuite/uniref30/current/ depuis le cluster IPOP-UP ? Ou si je ne peux y accéder que via le cluster de IFB ?

Merci d’avance,
Bonne journée
Amélie

2

Bonjour,

À la différence des environments applicatifs, les banques ne sont pas répliquées d’un cluster à l’autre.

Je peux installer ces deux banques si vous le souhaitez.

Cordialement.

3

Je veux bien ! Merci de votre réponse.
J’aurai besoin de UniRef30_2022_02 et pfam35.

https://wwwuser.gwdg.de/~compbiol/uniclust/2022_02/
https://wwwuser.gwdg.de/~compbiol/data/hhsuite/databases/hhsuite_dbs/

Merci beaucoup,
Cordialement,
Amélie

4

J’ai installé les deux banques dans /shared/banks/hhsuite.

Cordialement.

1 Like
5

Merci beaucoup,

Amélie