Bonjour,
Merci beaucoup pour l’accès et pour votre rapidité !
Je suis désolé pour vous embêter avec ça, mais quand je lance un test de colabfold (pas ht-colabfold) avec la documentation rbps, je reçois une erreur:
sbatch: error: Batch job submission failed: Invalid account or account/partition combination specified
Mais quand je lance sans spécifier de partition ça va automatiquement au partition “ipop-up”. Est-ce possible que:
-A ht-colabfold
n’a pas accès à rpbs? (ni les 2 autres partitions gpu).
Mon script est dans:
/shared/projects/ht-colabfold/one_singularity_colabfold_test.sh
Et je le copie ici au cas ou:
#!/bin/bash
#SBATCH -p rpbs
#SBATCH -A ht-colabfold
#SBATCH -c 2
#SBATCH --gres=gpu:1
#SBATCH -o 2nd_test.out
#SBATCH -e 2nd_test.err
#SBATCH --job-name=2nd_test
srun singularity run
–bind /shared/banks/alphafold2/2022-12-13/:/root/.cache/colabfold
–nv /shared/software/singularity/images/alphafold-colabfold_1.5.2-rpbs.sif
colabfold_batch
/shared/projects/ht-colabfold/ezl1_gtsf1.fa
/shared/projects/ht-colabfold/test_outputs
–num-seeds 20
–num-recycle 12
–msa-mode mmseqs2_uniref_env
–model-type alphafold2_multimer_v3
–rank multimer
–pair-mode unpaired_paired
–num-models 5
–use-dropout
–save-recycles
Désolé si c’est moi qui ne comprends pas, j’ai pas habitude à utiliser des partitions/compte spécifique. Encore merci, et cordialement,
Julien